O Centro de Ensino e Pesquisa Clínica (CEPEC) foi idealizado em 2008, no Hospital Santa Marcelina de Itaquera, com o objetivo de oferecer a infraestrutura adequada para o desenvolvimento de todas as etapas dos estudos clínicos e epidemiológicos realizados na instituição. Destacam-se os avanços e desenvolvimento de pesquisas e estudos em Hematologia e Hemoterapia, Neurologia, Oncologia (adulto e pediátrico), Cardiologia Clínica e Intervencionista.

Por meio do CEPEC, o Hospital já participou de mais de 270 estudos de pesquisas clínicas, e atualmente possui 63 estudos ativos entre Fase Regulatória, Recrutando e Acompanhamento. Desde sua inauguração, 1.530 pacientes já foram beneficiados por um protocolo de pesquisa clínica.

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